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　　一、1938～1949年，建所創(chuàng)業(yè)時期?

　　地域特殊、地貌復雜、氣候多樣，云南孕育的植物種類十分豐富，是國內(nèi)外學者關注的熱點地區(qū)。最早采集中國植物標本的是歐洲人，可追隨到17世紀中葉，在過去的400多年里，到中國采集植物的外國人達300余人，采集標本達120多萬份，中國植物物種70％以上的模式標本存于國外各大標本館。從19世紀開始國外學者足涉云南，考察和采集植物標本，有英國外交官A. Henry、法國人P. Vial、H. Leduc、Tanant（均為法國駐蒙自領事）等，20世紀有法國人J. P. Cavaletie、F. Ducloux（均為法國天主教神甫）、英國人F. Kingdon Ward（植物學家和探險家）、G. Forrest（愛丁堡采集員）、奧地利人H. Handel-Mazzetti、瑞典人H. Smith等。中國學者鐘觀光開國人赴云南采集之先河，1919年到大理采集標本。此后，秦仁昌、蔣英、鄭萬鈞、汪發(fā)纘、郝景盛、劉慎諤、俞德浚、蔡希陶、王啟無、馮國楣等先后入滇采集，為昆明植物所前身云南農(nóng)林植物研究所的成立奠下基礎。?

　　1938年，北平靜生生物調(diào)查所和云南省教育廳合辦的云南農(nóng)林植物研究所成立，胡先骕任所長（1938-1950），嚴楚江任副所長（1938-1940），次后，汪發(fā)纘（1938-1940）、鄭萬鈞（1940-1943）、俞德浚（1943-1947）、蔡希陶（1947-1950）任副所長。?

　　成立于抗戰(zhàn)烽火中的農(nóng)林植物所，集聚了胡先骕、嚴楚江、汪發(fā)纘、唐進、陳封懷、陳煥鏞、匡可任、王啟無、鄭萬鈞、俞德浚、張英伯、蔣英、蔡希陶等著名植物學家，在云南省政府的支持下，進行了包括森林樹種、經(jīng)濟植物、藥用植物的調(diào)查采集、煙草的引種栽培試驗、云南松地理種源的生態(tài)習性觀察和重要喬灌木植物的繁殖試驗等多項研究。編輯出版年度研究匯報。?

　　二、1950～1976年，鞏固、恢復時期?

　　1950年，昆明解放后，原云南農(nóng)林植物研究所被接收改建為中國科學院植物分類研究所昆明工作站，蔡希陶任主任。?

　　在中國科學院和植物研究所的領導和部署下，昆明工作站集中主要科研人員參加了橡膠宜林地考察、經(jīng)濟植物的引種栽培試驗研究、茶花的生物學特性觀察和栽培栽培研究、云南熱帶生物資源考察和中蘇聯(lián)合考察紫膠寄主植物資源聯(lián)合考察等與國家經(jīng)濟建設密切相關科研任務。建立了植物分類組、種苗組、標本分類組、植物園、圖書資料組等科研組織，籌建元江保植站。此期間，一批大學畢業(yè)生分配到所工作，增加工作站的新生力量。?

　　1957年，三幢品字形科研大樓竣工，極大改善昆明工作站的科研硬件條件。昆明工作站的科研工作緊密結(jié)合國家需求是這一時期的特點。?

　　1958年，開始籌建昆明植物研究所，向中國科學院上呈報昆明工作站轉(zhuǎn)升昆明植物研究所的請示報告。?

　　1959年，中國科學院批準成立中國科學院昆明植物研究所，任命吳征鎰為所長，蔡希陶、蒲代英為副所長。同年，開建西雙版納熱帶植物園，蔡希陶兼任主任，周鳳翔任副主任。?

　　1962年，改為中國科學院植物研究所昆明分所，吳征鎰任所長，蔡希陶、蒲代英任副所長。?

　　1966年，昆明分所的科研單元有植物分類研究室、植物資源化學研究室、植物生理研究室、昆明植物園、地植物組、土壤組等研究單元，西雙版納熱帶植物園、大勐籠熱帶森林生物地理群落站、麗江高山植物園、元江引種站的建成，擴大了研究所研究領域的覆蓋面。昆明植物所進入新的發(fā)展階段。?

　　同年，文化大革命開始，原所領導靠邊，成立革命委員會籌備組，羅鴻源任組長，李生堂、張斌任副組長。?

　　1968-1970年，成立中國科學院植物研究所昆明分所革命委員會，主任暫缺，何泰怡、劉忠福、蔡友昌任副主任。?

　　1970年，整所下放云南省管理，改為云南植物研究所，歸口云南省科委領導。?

　　1971年，吳征鎰任所革命委員會主任，增加趙元禎（1971-1976）、晉紹武（1974-1976）、陳家杰（1975）、張敖羅（1975-1976）、段亞華（1975-1976）為副主任。西雙版納熱帶植物園改為云南熱帶植物研究所，歸口云南省科委和西雙版納自治州雙重領導。?

　　整個文化大革命期間，軍宣隊、工宣隊進駐研究所，以“文革”為主，延續(xù)十年，科研基本停頓，時光耽誤。所幸昆明植物所的整體建制和主要實施設備未受重大損壞。1976年后，迎來科學的春天，昆明植物所猶如青春煥發(fā)，得以迅速復興。?

　　三、1977-1996年，科技體制改革和發(fā)展時期?

　　1978年，中國科學院決定收回原屬研究所，改為中國科學院昆明植物研究所，原所革命委員會于1979年撤銷，恢復所長制，中國科學院任命吳征鎰為所長，蔡希陶（1979-1981）、張敖羅（1979-1983）、徐達（1980-1986）、周俊（1980-1986）、車奇云（1982-1983）為副所長。時云南熱帶植物研究所更名為中國科學院云南熱帶植物研究所。?

　　1983-1986年，中國科學院任命吳征鎰為名譽所長，周俊任代所長，1985年，正式任命周俊為所長，蘇蓉生（1983-1985）、王守正（1983-1986）、陳書坤（1985-1986）為副所長。?

　　1987年，中國科學院決定調(diào)整云南的生物研究所，將云南熱帶植物研究所的群落室與昆明分院生態(tài)研究室合并建中國科學院昆明生態(tài)研究所，其他部分合并昆明植物所，新建民族植物研究室。吳征鎰任名譽所長，周俊任所長，裴盛基、陳書坤、王守正（1987-1988）、許再富任副所長。?

　　1990-1994年，中國科學院任命孫漢董為所長，許再富、呂春朝、辛正才為副所長。?

　　1995-1998年，中國科學院任命許再富為所長，郝小江為常務副所長、呂春朝為副所長。1996年底，中國科學院決定西雙版納熱帶植物園從昆明植物所建制分出，昆明生態(tài)研究所整所并入西雙版納熱帶植物園。許再富任調(diào)整后的西雙版納熱帶植物園籌建組長。?

　　四、1997～2008年，科技創(chuàng)新時期?

　　1997-2001年，昆明植物所領導班子提前換屆，任命郝小江為所長，劉培貴、李德銖、楊永平為副所長。?

　　2002-2005年，任命郝小江為所長，孫航為常務副所長，劉培貴、李德銖、楊永平為副所長。?

　　2006-2008年，任命李德銖為所長，孫航、劉吉開、楊永平、甘煩遠為副所長。?

　　在“改革開放”方針的指引下，國家進入以經(jīng)濟建設為中心的新時期，科技體制改革向縱深發(fā)展。1987年和1996年經(jīng)歷兩次重大體制調(diào)整后，在國家和中國科學院的關懷和支持下，昆明植物所建成植物化學與西部植物資源持續(xù)利用國家重點實驗室、生物地理與生物多樣性院重點實驗室和中國西南野生生物種質(zhì)資源庫等重點研究單元，學科布局和科研特色進一步優(yōu)化；綜合科研大樓、國家重點實驗室大樓、種質(zhì)資源庫大樓、標本館、圖書館、物業(yè)中心大樓、研究生公寓和文化廣場等竣工，科研區(qū)建設煥然一新；科研實施設備和儀器裝備得到大幅提升；研究生培養(yǎng)體系進一步完善，科研隊伍的素質(zhì)、結(jié)構和數(shù)量空前提高和改善，一代年輕而優(yōu)秀的科技人員肩負著科技創(chuàng)新的重任，昆明植物所進入嶄新的知識創(chuàng)新發(fā)展時期。?